En sistemas UNIX en general y Linux en particular, GPG es buena opción para estas tareas.
Suponiendo que se dispone de la herramienta GPG instalada y la unilidad en linea de comandos 'gpg', se pueden encriptar/desencriptar archivos de la siguiente forma:
Cifrado del archivo "ARCHIVO_A_CIFRAR" manteniendo el original.
#> gpg --symmetric -o ARCHIVO_CIFRADO.gpg ARCHIVO_A_CIFRAR
En el proceso se solicita la clave de cifrado.
Por defecto el algoritmo de cifrado es 'Cast5', considerado cifrado fuerte.
Descifrado.
#> gpg -d -o ARCHIVO_DESCIFRADO ARCHIVO_CIFRADO.gpg
En el proceso se solicita la clave de cifrado.